El Departamento de Biomasa de CENER realiza actividades de investigación aplicada en el área de la biomasa, prestando servicios en I+D y asistencia técnica a todos los agentes del sector. La actividad del departamento está focalizada en el desarrollo y optimización de los procesos de producción de bioproductos, biocombustibles sólidos, biocombustibles líquidos y gaseosos avanzados, así como conceptos de biorrefinería.

Dispone de infraestructuras que incluyen un Laboratorio de Biomasa (en el que se realiza la caracterización de biomasa y biocombustibles, y se desarrollan procesos a escala de laboratorio), así como el Centro de Biorrefinería y Bioenergía (BIO2C), que es una instalación de ensayos a escala demostrativa semi-industrial.